安装指南

主包

可以使用以下任意一条conda命令来安装 scglue 包：

conda install -c conda-forge -c bioconda scglue  # CPU only
conda install -c conda-forge -c bioconda scglue pytorch-gpu  # With GPU support

或者，也可以使用pip命令：

pip install scglue

备注

为了避免可能出现的依赖冲突，建议在 conda 环境 中安装。

可选依赖项

scglue 包中的一些函数通过k-Means聚类进行 “metacell” 聚合，安装 faiss 包可以显著提高运行速度。

您可以通过 官方指南 安装 faiss。

好了，您已经准备好了！请进入 教程 了解如何使用 scglue 包。