安装指南
主包
可以使用以下任意一条conda命令来安装 scglue
包:
1conda install -c conda-forge -c bioconda scglue # CPU only
2conda install -c conda-forge -c bioconda scglue pytorch-gpu # With GPU support
或者,也可以使用pip命令:
1pip install scglue
备注
为了避免可能出现的依赖冲突,建议在 conda 环境 中安装。
可选依赖项
scglue
包中的一些函数通过k-Means聚类进行 “metacell” 聚合,安装 faiss 包可以显著提高运行速度。
您可以通过 官方指南 安装 faiss
。
好了,您已经准备好了!请进入 教程 了解如何使用 scglue
包。